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Caratterizzazione degli eventi di riconoscimento molecolare e regolazione nei signalosomi della retina

#retinasignalosomes

Descrizione

Uno dei misteri più affascinanti della percezione visiva risiede nelle precise funzioni degli intricati circuiti molecolari della retina. I contatti sinaptici tra diversi tipi di cellule consentono la trasformazione dei segnali luminosi in precisi messaggi chimici, che raggiungono infine il nostro cervello. Tuttavia, per molte di queste macromolecole chiave, le nostre attuali conoscenze sono estremamente limitate. Nel nostro progetto utilizziamo le tecnologie in vitro più avanzate per caratterizzare le strutture, le interazioni e le funzioni di reti proteiche recentemente scoperte, chiamate “segnalasomi”, essenziali per la percezione visiva, in particolare per la visione notturna. Il nostro obiettivo è raccogliere informazioni per fornire una mappatura molecolare accurata delle interazioni alla base di queste proteine ​​fondamentali e, allo stesso tempo, chiarire i difetti molecolari che causano rare malattie della vista incurabili, come la cecità notturna congenita stazionaria. Prevediamo che i nostri risultati apriranno la strada a nuove ed entusiasmanti opportunità per l’utilizzo e lo sfruttamento di queste molecole in future applicazioni biomediche.

schematic of our investigation targets in the retina, at the synaptic interface between photoreceptors and bipolar cells

La figura mostra uno schema riassuntivo dei nostri obiettivi di ricerca nella retina, all’interfaccia sinaptica tra fotorecettori e cellule bipolari.

Pikachurina e le sue interazioni con GPR179– Nella retina, i fotorecettori formano contatti sinaptici con le cellule bipolari di tipo ON per garantire un’efficiente trasmissione sinaptica. La pikachurina, un proteoglicano della matrice extracellulare e ligando distroglicano con caratteristiche fortemente simili a quelle del suo omologo ampiamente diffuso, l’agrina, collega un complesso presinaptico sul fotorecettore con il recettore orfano postsinaptico GPR179. Abbiamo affrontato la caratterizzazione strutturale e funzionale dei frammenti N- e C-terminali della pikachurina e, in collaborazione con il gruppo di Kirill Martemyanov presso lo Scripps in Florida, abbiamo studiato i contatti molecolari extracellulari che consentono l’interazione tra il dominio EGF3 C-terminale della pikachurina e l’ectodominio di GPR179. I nostri risultati forniscono informazioni su come la pikachurina posiziona con precisione GPR179 a livello delle sinapsi per garantire la neurotrasmissione.

Cartoon representation of the CryoEM reconstruction of the extracellular fragments of dimeric GPR179 (blue and green) forming 2:2 complexes with the C-terminal EGF3 domains of human Pikachurin

La figura mostra una rappresentazione schematica della ricostruzione CryoEM dei frammenti extracellulari del GPR179 dimerico (blu e verde) che formano complessi 2:2 con i domini EGF3 C-terminali della Pikachurina umana.

Risorse

PDB Files:

  • 7ZCB– Struttura cristallina dei domini N-terminali di Fibronectina-III (1-2) della Pikachurina umana/EGFLAM
  • 7ZC9– Struttura cristallina del dominio C-terminale di Laminina-G (LG3) della Pikachurina umana/EGFLAM
  • 8D1B– Struttura CryoEM del GPCR orfano umano GPR179 in complesso con la proteina della matrice extracellulare pikachurina

File EMDB:

  • EMD-27121– Struttura CryoEM del GPCR umano orfano GPR179 in complesso con la proteina della matrice extracellulare pikachurina

File SASBDB:

  • SASDN78– Frammento N-terminale FnIII(1-2) della pikachurina (SEC-SAXS)
  • SASDN68– Dominio LG3 C-terminale della pikachurina (SEC-SAXS)
  • SASDN88– Frammento C-terminale EGF-LG3 della pikachurina (SEC-SAXS)

Pubblicazioni e disseminazione

Pubblicazioni

Comunicati stampa

  • Comunicato stampa congiunto dell’Università di Pavia relativo a Patil et al., Science Signaling (2023): PDF in italiano

Progetti

Velux Stiftung

Velux Stiftung, Ophthalmology Grant: "Caratterizzazione molecolare dei circuiti della visione mediata dai bastoncelli in condizioni fisiologiche e patologiche" – Codice progetto 1375

GAHF CDA

Giovanni Armenise Harvard Foundation, Career Development Award: "Riconoscimento molecolare nella sinapsi neuromuscolare" – Codice progetto CDA 2013